Mesmo quando criança, Lara era movida por uma curiosidade insaciável. Seu pai, Lorde Richard Croft, arqueólogo e aristocrata, frequentemente partia em expedições durante a infância da filha, forçando-a a se tornar independente desde cedo.
Foi na universidade que ela conheceu sua melhor amiga, Samantha Nishimura. Sam incentivou Lara a se divertir e experimentar a vida além dos tranquilos corredores de escolas e museus.
Quando surgiu a oportunidade de participar de uma expedição arqueológica à ilha de Yamatai, Lara agarrou a chance. Seu mentor, Conrad Roth, escolheu ela e Sam para fazerem parte da viagem.
Antes de chegarem à ilha, tudo saiu dos trilhos. O navio em que as duas estavam foi surpreendido por uma tempestade e se partiu ao meio, espalhando os membros da expedição pelo litoral da ilha. Lara se esforçou para reencontrar sua equipe enquanto evitava a perseguição da sinistra Irmandade Solarii, que infestava o local. Ela conseguiu encontrar Sam junto a um habitante chamado Mathias, que parecia ter sido abandonado na ilha. Porém, quando Lara desmaiou, Sam e Mathias desapareceram.
Na busca por Sam, descobriu que a Irmandade procurava por um receptáculo para uma antiga rainha e, guiada por Mathias, Lara se convenceu de que esse receptáculo era Sam. Quando Lara finalmente os localizou em uma caverna sob uma cachoeira, descobriu que tinham amarrado Sam a uma pira, prestes a testar se ela era a escolhida... ou se queimaria até a morte.
Numa tentativa desesperada de salvar a amiga, Lara disparou uma flecha, derrubando o portador da tocha. Mas ela estava em menor número e foi imediatamente capturada e espancada pela Irmandade. Enquanto dois guardas a levavam por uma ponte de pedra natural, uma névoa escura e desconhecida os cercou. Com seus captores distraídos, ela se libertou e saltou da ponte para o rio de sangue abaixo.
Enquanto afundava, dezenas de membros se estenderam em sua direção, a agarraram, arrancaram seu arco e a puxaram para baixo. Era como se o rio tivesse vida própria. Ela esperneou e se debateu para alcançar a superfície. Finalmente, Lara emergiu das vísceras doentias do rio e se viu em um pesadelo completamente diferente.
